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A Liga €mpresarial de Futsal da época 2008/09 ainda se realizou sob o nome da Liga Elite Futsal Empresas. Foi o ano de transição para o segmento empresarial.A prova realizou-se em duas zonas, Norte e Sul, tendo a Zona Norte duas séries de 9 equipas e a Zona Sul, uma série de 8 equipas.
O formato desta prova contou com uma fase regular e uma fase final em cada zona e terminou com a realização da Final Four Nacional.
A Zona Norte dividiu-se em duas séries, uma localizada na Maia e outra no Porto. Na Zona Sul, apenas se realizou uma série em Lisboa.
